Pendaftaran dan seleksi calon mahasiswa Program S3 Minat Studi Perekonomian Islam dan Industri Halal dilaksanakan melalui tiga jalur berbeda, yaitu jalur seleksi reguler, jalur seleksi kerjasama dan jalur seleksi internasional.
- Jalur Reguler
Diperuntukkan bagi calon mahasiswa Program S3 Minat Studi Perekonomian Islam dan Industri Halal dengan biaya sendiri, calon mahasiswa dengan biaya dari instansi tempatnya bekerja, dan calon mahasiswa dari masyarakat umum yang sedang mengajukan beasiswa dari berbagai Kementerian di Republik Indonesia.
- Jalur Kerjasama
Diperuntukkan bagi calon mahasiswa Program S3 Minat Studi Perekonomian Islam dan Industri Halal yang dibiayai oleh organisasi mitra Universitas Gadjah Mada yang memiliki memorandum of understanding (MoU) kerjasama.
- Jalur Internasional
Diperuntukkan bagi calon mahasiswa Program S3 Minat Studi Perekonomian Islam dan Industri Halal yang memiliki kewarganegaraan asing (WNA).
Keterangan lebih lengkap mengenai jalur-jalur seleksi calon mahasiswa tersebut dapat dilihat di sini.