Pendaftaran dan seleksi calon mahasiswa Program S2 Minat Studi Ekonomi Islam dilaksanakan secara rutin sebanyak dua kali dalam satu tahun, yaitu jelang semester ganjil dan jelang semester genap. Jadwal pendaftaran dan seleksi calon mahasiswa tersebut mengikuti jadwal resmi dari universitas.
Semester Ganjil
Pendaftaran dan seleksi calon mahasiswa jelang semester ganjil dilaksanakan sekitar awal januari hingga Juli setiap tahun.
Semester Genap
Pendaftaran dan seleksi calon mahasiswa jelang semester genap dilaksanakan sekitar awal bulan November hingga awal bulan Januari setiap tahun.